De Yamaha MT-09 is standaard en heeft krachtige 889 cc CP3-conforme EU5-motor. Dit blok geeft nog meer koppel bij lagere toerentallen, voor nog explosievere acceleraties en betere wegprestaties. Yamaha voorzag de 09 van een hightech 6-assige IMU welke de hoogwaardige elektronische hulpmiddelen aanstuurt voor ultieme controle.